Asociacija „Slėnis Nemunas“ yra atvira, jos nariu gali tapti bet kuri pareiškusi pageidavimą mokslo, studijų ar verslo bei kita institucija (ar net pavieniai asmenys), jeigu jų vykdoma veikla susijusi su Slėnio Programa ir gali prisidėti prie jos veiklos vertinimo kriterijų gerinimo. Slėnio nario priėmimą sprendžia Steigėjų susirinkimas Slėnio tarybos teikimu.
Pirmoji institucija, pareiškusi norą tapti Slėnio nariu yra Lietuvos žemės ūkio konsultavimo tarnyba (LŽŪKT). LŽŪKT turi patyrimą mokslo rekomendacijas skleisti Lietuvos žemės ūkio sektoriuje, o tai yra vienas iš Slėnio tikslų.
Asocacijos nariais taip pat tapo Mykolo Romerio universitetas, Lietuvos agrarinės ekonomikos institutas, UAB Elinta VS.
Asociacijos nariais tapti pareiškė norą UAB „Visalaukės technologijų parkas“ ir Inžinerinės ekologijos asociacija.